XIII. yüzyılda Selçuklular döneminde inşa edilmiştir. Yapının üzerinde herhangi bir kitabe bulunmaması, tarihi ve amacı hakkında bir gizem oluşturmaktadır. Başlangıçta bir han olarak inşa edilen bu bina, Kayseri'nin eski şehir surları içinde, geceleri kapılar kapandığında geç kalanların sığındığı bir sığınak olarak hizmet vermiştir. Zamanla ihtiyaçlar değişmiş ve bina bir cami ve ibadet yeri haline gelmiştir. Kesme taşlardan oluşan iç ve dış tasarımı bölgenin karakteristik özelliklerini taşımaktadır.

İçerisinde atmosferi ile taş dokusu ile o dönemleri anlamaya çalışmak ve o eski havayı teneffüs etmek ilginç bir deneyim.

Bir yalnızlık ve ürkütmeyen bir karanlık size eşlik ediyor size.

Bir Selçuklu eseri olan Han Camii, hafif dikdörtgen şeklinde ve masif kalın duvarlar ile çevrilidir.

Han Camiinin geçmişinde şehrin kale surlarına dayandığı bilinmektedir.
Surların kapı kısmı kapandığında misafirleri ilk bu mekanın karşıladığı anlaşılıyor.